Analýza konsorcií methanogenů s využitím molekulárně biologických metod

Abstract

Předložená diplomová práce se zabývá studiem methanogenních mikroorganismů z domény Archaea. Cílem této práce bylo vytipovat vzorky obsahující gen mcrA, tedy provést screening konsorcií methanogenů v rámci společenstva vyskytujícího se ve vybraných hnědouhelných a černouhelných lokalitách na území České republiky, a vytipovat tak uhelné lokality s největším potenciálem pro podporu biogenní methanogeneze. Zacílením na gen mcrA proběhla analýza reálných vzorků černého a hnědého uhlí a také důlních vod, dále byly analyzovány další environmentální vzorky. Gen mcrA byl detekován pomocí metod PCR a qPCR. Absolutní kvantifikace genu mcrA proběhla metodou klonování. Jednotlivé molekulárně biologické metody byly optimalizovány za účelem zpřesnění výsledků. Z toho důvodu byly také navrženy specifické DNA próby. Přítomnost genu mcrA byla potvrzena v 15 vzorcích černého uhlí, 13 vzorcích hnědého uhlí a 4 dalších environmentálních vzorcích.