Detekce nežádoucích mikroorganismů pomocí izotermální amplifikace DNA

Los, Jiří

Detekce nežádoucích mikroorganismů pomocí izotermální amplifikace DNA

DSpace Repository

Language: English čeština

Detekce nežádoucích mikroorganismů pomocí izotermální amplifikace DNA

dc.contributor.advisor	Koutný, Marek
dc.contributor.author	Los, Jiří
dc.date.accessioned	2013-10-09T03:13:03Z
dc.date.available	2013-10-09T03:13:03Z
dc.date.issued	2012-02-13
dc.identifier	Elektronický archiv Knihovny UTB	cs
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10563/22888
dc.description.abstract	Tato bakalářská práce je zaměřena na aplikovatelnost metody izotermální amplifikace DNA (LAMP) pro přímou detekci mykobakterií ve vodách. Shromažďuje současné teoretické poznatky, na jejichž základě proběhly experimenty potvrzující danou metodu a představuje tak ucelený úvod do dané problematiky. Podařilo se nám optimalizovat reakční podmínky pro detekci Mycobacterium phlei pomocí LAMP a detekce barvivem SYBR Green. Optimální reakční podmínky byly 63°C a koncentrace Mg2+ 4 mM. Produkt lze bezpečně detekovat po 90 minutách. Zjistili jsme, že detekce M. phlei pomocí fluorescenčního DNA barviva GelStar v UV je výrazně méně citlivá a spolehlivá. M. phlei se nám podařilo ve všech případech detekovat gelovou elektroforézou v agarosovém gelu.	cs
dc.format	47 s. (60 428 znaků)	cs
dc.format.extent	1518419 bytes	cs
dc.format.mimetype	application/pdf	cs
dc.language.iso	cs
dc.publisher	Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně
dc.rights	Bez omezení
dc.subject	LAMP	cs
dc.subject	PCR	cs
dc.subject	DNA	cs
dc.subject	primer	cs
dc.subject	izotermální amplifikace	cs
dc.subject	GelStar	cs
dc.subject	SYBR Green	cs
dc.subject	Keywords: LAMP	en
dc.subject	PCR	en
dc.subject	DNA	en
dc.subject	primer	en
dc.subject	Isothermal Amplification	en
dc.subject	Gel Star	en
dc.subject	SYBR Green	en
dc.title	Detekce nežádoucích mikroorganismů pomocí izotermální amplifikace DNA	cs
dc.title.alternative	Detection of Undesirable Microorganisms with Isothermal DNA Amplification	en
dc.type	bakalářská práce	cs
dc.contributor.referee	Wunderlichová, Leona
dc.date.accepted	2012-06-14
dc.description.abstract-translated	This bachelor thesis is focused on the applicability of the loop mediated isothermal DNA amplification (LAMP) for the direct detection of Mycobacteria in water. It reviews contemporary theoretical information together with practical experimental testing of the LAMP method and also represents coherent introduction to the LAMP issues. We optimized reaction conditions for the detection of Mycobacteria phlei with SYBR Green DNA stain. The optimal conditions were 63°C and 4 mM of Mg2+. The Product could be securely detected after 90 minutes of the reaction. We found out, that the detection of Mycobacteria phlei by fluorescence GelStar DNA stain in UV is not reliable and enough sensitive. By agarose gel electrophoresis we successfully detected Mycobacteria phlei in all cases.	en
dc.description.department	Ústav inženýrství ochrany životního prostředí	cs
dc.description.result	obhájeno	cs
dc.parent.uri	http://hdl.handle.net/10563/140	cs
dc.parent.uri	http://hdl.handle.net/10563/220	cs
dc.thesis.degree-discipline	Inženýrství ochrany životního prostředí	cs
dc.thesis.degree-discipline	Enviromental Protection Engineering	en
dc.thesis.degree-grantor	Univerzita Tomáše Bati ve Zlíně. Fakulta technologická	cs
dc.thesis.degree-grantor	Tomas Bata University in Zlín. Faculty of Technology	en
dc.thesis.degree-name	Bc.	cs
dc.thesis.degree-program	Chemie a technologie materiálů	cs
dc.thesis.degree-program	Chemistry and Materials Technology	en
dc.identifier.stag	25338
utb.result.grade	A
dc.date.submitted	2012-05-18