Если включено, Jenkins будет запускать сборки отдельных модулей как отдельные сборки. В проектах с большим количеством модулей или в проектах, где сборка модулей занимает продолжитьельное время, установка этой опции может ускорить сборку всего продукта, так как независимые модули могут собираться параллельно.

В противном случае оставьте опцию непомеченой и Jenkins будет выполнять сборку проекта так, как будто вы запустили её из командной строки.

Если ваша сборка использует "aggregator-style" моджо (mojos) мультимодульного оповещения вам не нужно включать эту опцию, так чтобы моджо имел доступ ко всем вашим модулям.

Исторически это являлось поведением по-умолчанию родных проектов maven до версии Jenkins 1.133. Если ваш проект был создан ранее этой версии, вы, вероятно, захотите выключить эту опцию.